home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00375 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.8 KB  |  39 lines
  1. ****************************************************
  2. * Bacterial quinoprotein dehydrogenases signatures *
  3. ****************************************************
  4.  
  5. Pyrrolo-quinoline quinone (PQQ) is  redox coenzyme, which serves as a cofactor
  6. for a number of enzymes (quinoproteins)  and  particularly  for some bacterial
  7. dehydrogenases [1,2].    A number of these bacterial quinoproteins are clearly
  8. evolutionary related. These proteins are listed below.
  9.  
  10.  - Methanol dehydrogenases (MDH) (EC 1.1.99.8), from methylotrophs.
  11.  - Ethanol dehydrogenases from Acetobacter aceti [3].
  12.  - Glucose dehydrogenase   (EC 1.1.99.17)  from   Acinetobacter calcoaceticus,
  13.    Escherichia coli, and Gluconobacter oxydans [4].
  14.  
  15. These dehydrogenases all have from 600 to 800 amino acids.  We  developed  two
  16. signature patterns for these  proteins using sequence data from well conserved
  17. regions: the first one is located in  the N-terminal half while the second one
  18. is from the C-terminal half.
  19.  
  20. -Consensus pattern: [DEN]-W-x(3)-G-[RK]-x(6)-[FYW]-S-x(4)-[LIVM]-N-x(2)-N-V-
  21.                     x(2)-L-[RK]
  22. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  23. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  24.  
  25. -Consensus pattern: W-x(4)-Y-D-x(3)-[DN]-[LIVMFY](4)-x(2)-G-x(2)-[STA]-P
  26. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  27. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  28.  
  29. -Last update: December 1992 / Patterns and text revised.
  30.  
  31. [ 1] Duine J.A., Jongenan J.A.
  32.      Annu. Rev. Biochem. 58:403-426(1989).
  33. [ 2] Gallop P.M., Paz M.A., Flueckiger R., Kagan H.M.
  34.      Trends Biochem. Sci. 14:343-346(1989).
  35. [ 3] Inoue T., Sunagawa M., Mori A., Imai C., Fukuda M., Takagi M., Yano K.
  36.      J. Bacteriol. 171:3115-3122(1989).
  37. [ 4] Cleton-Jansen A.-M., Dekker S., van de Putte P., Goosen N.
  38.      Mol. Gen. Genet. 229:206-212(1991).
  39.